isolats d’E. coli O157

isolats d’E. coli O157

Données globales sur les échantillons traités

Ce chapitre porte sur la provenance des agents isolés (selles et produits carnés), l’aspect des selles, l’âge et le sexe des patients et les mois durant lesquels les souches entéropathogènes ont été retrouvées.

Paramètres de la population étudiée 

Aspect macroscopique des selles 736 (43,48%) des 1677 échantillons de selles avaient un aspect franchement pathologique c’est-à-dire glaireux ou glairo-sanguinolent ou liquide. Les autres selles étaient pâteuses (39%) ou moulées (17%). Pour 3 échantillons, l’aspect n’était pas appréciable à cause de la faible quantité collectée.  Répartition des malades selon l’âge et le sexe Nous avons 994 garçons et 683 filles, âgés de 2 jours à 68 ans. Les nourrissons sont majoritaires. Le sexe ratio (H/F) est de 1,45.  Période de recrutement des malades Durant les 12 premiers mois de l’étude, 1364 (81 ,33%) patients ont été inclus. Le taux de recrutement annuel des malades a été de 6,80% (114 malades) en 2010 ; 79,36% (1331 malades) en 2011 et 13,84% (232 malades) en 2012 [Figure 6]. Figure 6 : Période de recrutement des malades à l’H

Agents entéropathogènes isolés

Lors de la culture des 1677 selles traitées durant notre étude, un agent entéropathogène classique a été retrouvé dans 369 selles (22%). Il s’agissait de Rotavirus (301), Salmonella Shigella (10) et Campylobacter jejuni agents entéropathogènes isolées chez nos patients E. coli O157 a été retrouvée dans 18 (16,36%) des 110 échantillons de produits carnés analysés au laboratoire de l’HEAR. Période de recrutement des malades à l’HEAR Agents entéropathogènes isolés Lors de la culture des 1677 selles traitées durant notre étude, un agent entéropathogène classique a été retrouvé dans 369 selles (22%). Il s’agissait de Salmonella (30), Adénovirus (14), E. coli obacter jejuni (1). Les virus représentent 85,36% de ces agents entéropathogènes isolées chez nos patients [Figure 7]. O157 a été retrouvée dans 18 (16,36%) des 110 échantillons de produits carnés analysés au laboratoire de l’HEAR. 37 EAR Lors de la culture des 1677 selles traitées durant notre étude, un agent entéropathogène classique a été retrouvé dans 369 selles (22%). Il s’agissait de : E. coli O157 (13), (1). Les virus représentent 85,36% de ces O157 a été retrouvée dans 18 (16,36%) des 110 échantillons de Figure 7: Agents entéropathogènes isolés au Laboratoire de l’H

Résultats de la culture des produits carnés 

Nombre d’isolats d’ La culture des 110 échantillons de produits carnés en bouillon trypticase soja a été positive pour 96 échantillons (87,27%). Après repiquage systématique sur gélose Mac Conkey Sorbitol, nous avons isolé 41 souches d’E. coli. sérogroupe E. coli O157 viande. Les souches d’E. coli ont représenté 42,70% de l’ensemble des germes isolés.  Répartition des isolats d’ Une souche au moins d’ d’animaux étudiées. Dans les détails, 15 souches proviennent des muscles des animaux et 3 de leurs intestins gents entéropathogènes isolés au Laboratoire de l’HEAR ( Résultats de la culture des produits carnés Nombre d’isolats d’E. coli O157 La culture des 110 échantillons de produits carnés en bouillon trypticase soja a été positive pour 96 échantillons (87,27%). Après repiquage systématique sur gélose Mac Conkey Sorbitol, nous avons E. coli. Parmi celles-ci, 18 isolats (44%) appartiennent au soit 18,75% de l’ensemble des germes isolés dans la ont représenté 42,70% de l’ensemble des germes isolés. Répartition des isolats d’E. coli O157 selon le produit carné Une souche au moins d’E. coli O157 a été isolée de chacune des 3 espèces d’animaux étudiées. Dans les détails, 15 souches proviennent des muscles des intestins [Tableau III]. 38 EAR (2010-2012) Résultats de la culture des produits carnés La culture des 110 échantillons de produits carnés en bouillon trypticase soja Après repiquage systématique sur gélose Mac Conkey Sorbitol, nous avons lats (44%) appartiennent au soit 18,75% de l’ensemble des germes isolés dans la ont représenté 42,70% de l’ensemble des germes isolés. O157 selon le produit carné O157 a été isolée de chacune des 3 espèces d’animaux étudiées. Dans les détails, 15 souches proviennent des muscles des 39 Tableau III : Origine des souches d’E. coli selon le produit carné à Dakar (2010-2012) Souches Mouton Bœuf Porc Total Muscle Intestin Muscle Intestin Muscle Intestin E coli 9 7 7 1 12 5 41 E. coli O157 7 0 4 1 4 2 18 Pourcentage 17% 12,25% 14,65% 43,90% E. coli O157 a été trouvée essentiellement dans les échantillons de produits carnés collectés à la SOGAS (94%), lieu de recueil de la majorité d’ente eux. Une seule souche provient des échantillons prélevés dans les Supermarchés ; nous n’en avons pas trouvé dans ceux achetés au niveau des marchés. 

Données sur les isolats d’E. coli O157

Au total, 31 souches d’E. coli O157 ont été isolées lors de cette étude ; 13 (42%) sont d’origine humaine et 18 (58%) proviennent d’un animal. Les 13 souches représentent 3,52% des 369 agents à potentiel entéropathogène isolés chez nos patients durant la période de l’étude.

Patients infectés par E. coli O157  Aspect des selles

Sur les 13 isolats d’origine humaine, 7 (53,8%) proviennent de selles moulées, 5 (38,5%) de selles pâteuses et 1 (7,7%) de selles glaireuses.  Age et sexe des patients Huit patients de sexe masculin (61,53%) hébergeaient la bactérie. Elle a été retrouvée surtout dans les tranches d’âge de 13 à 60 mois et de 6 ans à 10 ans (77%). Un seul nourrisson, de sexe masculin et âgé de 4 mois était infecté contre 2 patients dont l’âge se situe entre 21 ans et 40 ans .