CARACTERISATION MOLECULAIRE DES SOUCHES VIRALES DE L’HEPATITE B

CARACTERISATION MOLECULAIRE DES SOUCHES VIRALES DE L’HEPATITE B

Structure du virus de l’hépatite B

Morphologie et caractéristiques 

Le virus de l’Hépatite B (VHB) est un virus composé d’une enveloppe de nature lipidique, d’une capside icosaédrique dont le rôle est de protéger le génome viral. Trois formes différentes du virus de l’hépatite B ont été identifiées en microscopie électronique (figure 1) dans le sérum des patients infectés (Gaëtan Billioud, 2010) : il s’agit (Dane et al., 1970) :  des particules virales sphériques infectieuses de (42nm) appelées virions (ou particules de Dane) correspondant aux virions complets  des particules sphériques, très nombreuses de 18 à 25nm de diamètre, noninfectieuses (car dépourvues d’ADN)  et des particules en forme de bâtonnet. Les particules sphériques et celles en bâtonnets ont la même structure que l’enveloppe virale et portent l’AgHBs (figure 1). Figure 1 : Structure des particules virales (Dane) et subvirales (sphère et filament) du VHB (Billioud et al., 2010) Trois types différents de particules sont mises en évidence : (1) des particules virales infectieuses appelées particules de Dane, (2) des particules sous-virales (PSV) non infectieuses de forme allongées en bâtonnet et (3) des (PSV) non infectieuses de forme sphérique. 1 2 3 6 Les particules de Dane ou virions représentent le virus complet, infectieux. C’est un virus enveloppé possédant une capside icosaédrique qui renferme une molécule d’ADN circulaire, partiellement double brin avec un brin long de polarité négative et un brin court de polarité positive. L’enveloppe virale est une bicouche lipidique, provenant de la membrane des cellules hôtes, dans laquelle sont enchâssées des protéines de surface virales. Ces protéines de surface (L ou large, M ou médium et S ou Small) ont toutes la même spécificité antigénique. Elles contiennent une nucléocapside icosaédrique de 27 nm de diamètre (médecine/sciences, Janvier 1992). Les particules non- infectieuses sont composées de protéines d’enveloppe virales ancrées dans une bicouche lipidique empruntées à la cellule hôte. Ces dernières sont détectées en majorité dans le plasma d’un patient infecté par le VHB. Le VHB est un virus extrêmement stable dans le milieu extérieur, il résiste à la dessiccation, et à la chaleur. Il a un pouvoir infectieux qui se maintient plusieurs années à – 20°C. Figure2: Structure de la particule de Dane(Goffard, 2010) 

Organisation génomique

 Le génome du VHB est le plus petit génome connu parmi les virus à ADN (Robinson and Greenman, 1974). Il est composé d’un ADN circulaire partiellement double brin sur environ ¾ de sa circonférence. Malgré sa petite taille (3,2Kpb), l’ADN du VHB est porteur d’une très grande quantité d’informations (Kann M, 1998). C’est un ADN très compact, composé d’un brin court, ou brin (+) et d’un brin long complet, ou brin (-). Le brin long est le brin codant, avec une longueur constante. Son extrémité 5’ est liée de façon covalente à la polymérase virale via un pont phosphodiester. Le VHB présente une organisation génétique compacte. Sur le brin négatif de l’ADN du VHB 4 cadres ouverts de lecture ou ORF (open reading frame) ont étés identifiés (S, C, P, X) (Galibert et al., 1979). Un cadre de lecture ouvert est une séquence nucléotidique codante, permettant la transcription et la traduction du génome. Ces ORF se chevauchent et permettant au virus d’augmenter sa capacité codante. Ces ORFs (ORF S, C,P et X ) codent pour les protéines virales:  ORF S L’ORF S contient 3 codons d’initiation de la transcription, et code 3 types de protéines d’enveloppes. Ces protéines qui sont traduites à partir d’ARNm distincts constituent l’antigène de surface de l’hépatite B (HBsAg) (Tiollais et al., 1985). L’ORF S est divisé en 3 régions : la région S code l’AgHBs ou proteine majeure S, la région préS2/S code la protéine moyenne préS2 et la région préS1/préS2/S code la grande protéine préS1 (F.Soussan P and 2000; Yamamoto et al., 1994).  ORF C L’ORF C code les protéines de core ou protéines de capside.L’induction de la transcription au niveau du second codon d’initiation, de la région C donne lieu à la synthèse de la protéine de capside, l’AgHBc nécessaire à la formation des capsides virales. La lecture en phase des gènes pré-C + C conduit à la sécrétion d’une protéine non structurale qui diffère de la protéine de capside par la présence d’une séquence supplémentaire de 8 29 acides aminés (aa), en position N-terminale. Cette protéine de 16 kDa obtenue après une modification post-transcriptionelle constitue l’ AgHBe (Servant-Delmas et al., 2007).

Table des matières

INTRODUCTION
PREMIERE PARTIE : Rappel sur le virus de l’hépatite B
1. Historique
2. Classification du virus de l’hépatite B
3. Structure du virus de l’hépatite B
3.1. Morphologie et caractéristiques
3.2. Organisation génomique
3.3. Protéines virales
3.3.1. Protéines d’enveloppe (ou de surface)
3.3.2. La Protéine de la capside
3.3.3. La Polymérase virale
3.3.4. La Protéine X
4. Cycle de réplication viral
5. Diversité génétique du virus
5.1 Mécanisme de la diversité génétique
5.2 Conséquence de la diversité génétique du VHB
5.3 Mutation du VHB
6. Epidémiologie du VHB
6.1. Répartition géographique mondiale
6.2. Modes de transmission
7. Physiopathologie de l’infection à VHB
8. Histoire naturelle de l’infection à l’hépatite B
8.1. Hépatite aigüe
8.1.1. Forme classique
8.1.2. Forme fulminante
8.2. Hépatite chronique
9. Les marqueurs sérologiques
9.1. Hépatite aigüe
9.2. Hépatite chronique
10. Diagnostic de l’infection par le VHB
10.1. Diagnostic direct
10.1.1 Recherche des Ag viraux
10.1.2 Détection et quantification de l’ADN viral
10.2 Diagnostic indirect
11. Traitement et suivi de l’infection chronique à VHB
11.1 Objectifs du traitement
11.2 Stratégies thérapeutiques
DEUXIEME PARTIE
CHAPITRE I : JUSTIFICATIF, OBJECTIFS, CADRE DE L’ETUDE, ET l’ECHANTILLONNAGE
1- Justificatif de l’étude
2-Objectifs de l’étude
2.1 Objectif général
2.2 Objectifs spécifiques
3 -Cadre de l’étude
3.1-Les sites de prélèvement des échantillons
3.2 Le site de traitement des échantillons
4- Echantillonnage
CHAPITRE II : METHODOLOGIE
1- Détermination de la charge virale
1.1 Extraction
1.2 Amplification-détection
2 – Caractérisation moléculaire du VHB
CHAPITRE III : RESULTATS
CHAPITRE VI : DISCUSSION
CONCLUSION
REFERENCES
BIBLIOGRAPHIE

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