Mémoire Online: Biodiversité, reproduction et phylogénie des diatomées bleues du genre Haslea et valorisation de leurs pigments de type marennine

Sommaire: Biodiversité, reproduction et phylogénie des diatomées bleues du genre Haslea et valorisation de leurs pigments de type marennine

Phylogénie des diatomées bleues

Liste des illustrations
Liste des tableaux
I. Introduction bibliographique
I.1 Généralités sur les diatomées
I.2 Utilisation des diatomées
I.3 Classification des diatomées
I.4 Le genre Haslea
I.5 Haslea ostrearia
I.5.1 H. ostrearia et le verdissement des huîtres
I.5.2 Distribution géographique d’H. ostrearia
I.5.3 Dimensions d’H. ostrearia
I.5.4 Structure et ultrastructure d’H. ostrearia
I.5.5 Ecologie d’H. ostrearia
I.5.6 Physiologie d’H. ostrearia
I.5.7 La marennine
I.6 Objectifs du travail de thèse
II. Chapitre 1 : la reproduction sexuée chez H. ostrearia
II.1 Introduction générale
II.1.1 L’auxosporulation
II.1.2 Déroulement général de l’auxoporulation
II.1.3 La compatibilité sexuelle
II.1.4 Les facteurs induisant la reproduction sexuée
II.1.5 L’auxosporulation chez H. ostrearia
II.1.6 Les facteurs d’induction de l’auxosporulation chez H. ostrearia
II.2 La reproduction sexuée chez H. ostrearia : le facteur concentration
II.2.1 Introduction
II.2.2 Matériel et méthode
II.2.3 Résultats
II.2.4 Discussion
II.3 La reproduction sexuée chez H. ostrearia : l’impact du pré-conditionnement lumineux
II.3.1 Introduction
II.3.2 Matériel et méthode
II.3.3 Résultats
II.3.4 Discussion
II.4. La reproduction sexuée chez H. ostrearia : effet de lumières
qualitativement différentes
II.4.1 Effet de lumières monochromatiques
II.4.1 a Matériel et méthode
II.4.1 b Résultats
II.4. 2 Effet de quantités croissantes de radiations dans la zone rouge
proche infrarouge
II.4.2 a Matériel et méthode
II.4.2 b Résultats
II.4.3 Discussion
III. Chapitre 2 : la diversité biologique chez les diatomées bleues du genre Haslea
III.1 Introduction
III.2 La baie de Bourgneuf
III.3 Marennes-Oléron
III.4 Le détroit de Cattégat en Suède
III. 5 La Mer Noire et Haslea karadagensis
III.5.1 Introduction
III.5.2 Haslea karadagensis sp. nov. (Bacillariophyta), a new diatom
from the Black Sea producing a novel blue pigment (article)
III.5.3 Conclusion et perspectives
III.6. L’île de la Gomera et Haslea silbo
III.6.1 Introduction
III.6.2 Haslea silbo sp. nov. (Bacillariophyta), a new diatom from the
Canary Islands producing a marennine-like pigment evidenced by
spectrometric methods (article)
III.6.3 Conclusion et perspectives
III.7 Boulouris et Haslea provincialis
III.7.1 Introduction
III.7.2 Caractéristiques morphologiques d’H. provincialis
III.7.3 Aspects reproductifs
III.7.3 Aspects moléculaires
III.7.4 Aspects pigmentaires
III.7.4.1 Matériel et méthodes
III.7.4.2 Résultats
III.7.5 Conclusion et perspectives
IV. Chapitre 3 : méthodes moléculaires appliquées à l’étude des diatomées bleues
IV.1 La phylogénie du genre Haslea et des diatomées bleues
IV.1.1 Introduction
IV.1.2 Molecular phylogeny of the Haslea spp.
(pennate diatoms, Naviculaceae): “To be or not to be blue diatom” Is it the same? (article)
IV.2 Héritabilité de l’ADN mitochondrial chez H. ostrearia
IV.2.1 Introduction
IV.2.2 Inheritance of the mitochondrial DNA in the pennate diatom
Haslea ostrearia (Naviculaceae) during auxosporulation suggests a
uniparental transmission (article)
IV.3 Conclusion et perspectives
V. Chapitre 4 : les pigments bleus des diatomées du genre Haslea et leur valorisation
V.1 Introduction
V.2 Activités antivirales
V.2.1 Introduction
V.2.2 Matériel et méthodes
V.2.3 Discussion et perspectives
V.3 Activités antibactériennes
V.3.1 Introduction
V.3.2 Matériel et méthode
V.3.3 Résultats
V.3.4 Conclusion et perspectives
V.4 Fixation des pigments sur les organes des huîtres
V.4.1 Introduction
V.4.2 Matériel et méthode
V.4.3 Résultats, conclusion et perspectives
V.5 Biological activities of purified marennine, the blue pigment responsible for the greening of oysters (article)
V.6 The blue-grey pigments of H. karadagensis (Naviculaceae): the Putative utilization to colour the oysters and the Biological properties (article)
VI. Conclusion générale
VII. Bibliographie
VII. Annexes

Extrait du mémoire Biodiversité, reproduction et phylogénie des diatomées bleues du genre Haslea et valorisation de leurs pigments de type marennine

I : Introduction bibliographique
I.1 Généralités sur les diatomées
Les diatomées constituent un important groupe de microalgues brunes. Si leur diversité spécifique exacte est inconnue, elle est estimée à potentiellement 200 000 espèces réparties dans une centaine de genres (Mann, 1999). Organismes photosynthétiques possédant un exosquelette siliceux nommé frustule, les diatomées forment un maillon fondamental des cycles du carbone et de la silice en milieu aquatique (Kemp et al., 2006). Les diatomées fixent en effet annuellement un quart du carbone inorganique des océans (Granum et al., 2005), et 20% du carbone fixé par voie photosynthétique à l’échelle de toute la biosphère (Field et al, 1998 ; Smetaček et al, 1999). Ce sont d’importants producteurs primaires des milieux aquatiques (Goldman, 1992), elles sont à la base de nombreux réseaux trophiques, et elles font partie des principaux constituants du phytoplancton.

Phylogénie des diatomées bleues
Le frustule siliceux des diatomées est constitué de deux valves, l’épivalve et l’hypovalve. L’hypovalve, possédant une taille légèrement inférieure, est imbriquée dans l’épivalve. L’ensemble tient au moyen d’un ensemble de ceintures connectives qui forment le cingulum. Les valves siliceuses peuvent être ponctuées par des aréoles. Elles peuvent aussi être ornementées de conduits ou déhiscences permettent l’excrétion dans le milieu extérieur de composés ou la locomotion, comme les fultoportulae et rimoportulae chez les diatomées centriques et certaines araphides, et le raphé chez les diatomées pennées (Round et al., 1990 ; Ruck et Theriot, 2011).

Phylogénie des diatomées bleues
Les diatomées sont des organismes ubiquistes, qui peuvent peupler un grand nombre de milieux différents, et établir de nombreux types de relations avec d’autres organismes. Elles peuvent se trouver en eau douce comme en eau salée, dans des eaux tropicales comme dans les polaires, dans les glaces, dans des lacs de haute altitude (Smol et Stoermer, 2010). Certaines sont attachées aux plumes d’oiseaux aquatiques (Croll et Holmes, 1942), à l’épiderme de cétacés (Bennett, 1920), aux écailles de tortues (Wetzel et al., 2010). D’autres existent comme endosymbiontes des foraminifères (Lee et al, 1995), dans des thalles de lichens (Lakatos et al., 2004), à l’intérieur d’éponges (Bavestrello et al., 2000) ou sont au contraire les hôtes de cyanobactéries (Stewart et al., 1983).

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