Présentation du bactériophage T5
Un coliphage lytique (figure 7.1)
Le bactériophage T5 est un virus bactérien lytique ayant pour hôte la bactérie Escherichia Coli. Son cycle de vie peut être brièvement résumé de la manière suivante : le virus s’attache réversiblement sur le LPS par l’intermédiaire de ses trois fibres en L puis irréversiblement via une protéine de queue distale (pb5) se qui fixe spécifiquement sur une protéine de la membrane externe (FhuA). Suite à cette fixation, des changements conformationnels de la queue du phage se produisent et le “clapet” moléculaire (connecteur), reliant l’un des sommets de la capside à la queue du phage s’ouvre. L’ADN libéré est transporté linéairement, paire de bases après paire de bases à travers la queue du phage et des membranes de l’hôte, jusqu’au cytoplasme. Une protéine de l’extrémité distale de la queue du phage (pb2) fait fonction de pore et assure le passage à travers les membranes [11]. Ce transfert s’effectue en deux temps (voir section 7.5.2). Le programme génétique du virus est exprimé : il détourne le métabolisme de la bactérie afin de produire de nouvelles particules virales. Enfin, la paroi de la bactérie est lysée et les nouvelles particules virales sont libérées dans le milieu extérieur.
Structure (figure 7.2)
T5 est un bactériophage caudé (à queue) appartenant à la famille des Siphoviridae. L’appartenance à cette famille se fonde essentiellement sur des propriétés structurales. Ainsi un Siphoviridae est constitué d’une capside icosaédrale protéique prolongée par une longue queue protéique flexible, mais non contractile 1 . Le génome du virus est stocké sous forme d’ADN double brin, hautement compacté dans la capside. Pour plus de détails sur la structure de T5, voir [31] et l’annexe A.